How to Dismantle an Atomic Bomb і Vertigo Tour (2003-2006)

Праца над How to Dismantle an Atomic Bomb («Як абясшкодзіць атамную бомбу») пачалася ў канцы 2003 года. У ліпені 2004 года ў Ніцы, Францыя, была выкрадзена «сырая» запіс альбома. У адказ Боно заявіў, што калі альбом з'явіцца ў пірынгавых сетках, то яго неадкладна пачнуць распаўсюджваць праз краму iTunes, і на працягу месяца ён з'явіцца на прылаўках.

Першая песня альбома — Vertigo («Галавакружэнне») — была пушчана ў эфір 22 верасня 2004 гады і стала міжнародным хітом. Кампанія Apple разам з U2, выпусціла адмысловае выданне плэера iPod. На iTunes быў выпушчаны эксклюзіўны набор The Complete U2 («U2 цалкам»), які уключал раней не выдаваўшыяся матэрыялы. Выручка была перададзена дабрачынным арганізацыям.

Альбом быў выпушчаны 22 лістапада 2004 года, стартаваўшы як № 1 у 32 краінах, уключаючы Ірландыю, ЗША, Канаду і Злучанае Каралеўства. Толькі ў ЗША за першы тыдзень было прададзена 840000 копій альбома, што прыкладна ў два разы больш, чым продажы All that You Can’t Leave Behind за тое жа час, гэта было асабістым рэкордам групы. У тым жа годзе Брус Спрынгстын увёў U2 у 2005 годзе ў «Залу славы рок-н-ролла».

У сакавіку 2005 года U2 пачалі Vertigo Tour у Злучаных Штатах. Далей ён праходзіў у Еўропе і Лацінскай Амерыцы. На канцэртах выконвалася вялікая колькасць песень, уключаючы тыя, якія публіка не чула з пачатку 80-х: The Electric Co., An Cat Dubh/Into the Heart. Сакавіцкія паданні 2006 года ў Японіі, Новай Зеландыі, Аўстраліі і на Гаваях былі адкладзены да лістапада — снежня з-за хваробы аднаго з сваякоў чальца групы. Як і Elevation Tour, Vertigo … карыстаўся вялікім камерцыйным поспехам.

8 лютага 2006 года U2 былі ўручаны прэміі «Грэмі» у кожнай з пяці катэгорый, у якіх яны намінаваліся: «Альбом года» (за How to Dismantle an Atomic Bomb), «Песня года» (за Sometimes You Can’t Make It on Your Own), «Лепшы рок-альбом» (за How to Dismantle an Atomic Bomb), «Лепшае выкананне рока з вакалам» (за Sometimes You Can’t…), «Лепшая рок-песня» (за City of Blinding Lights).

25 верасня група выдала аўтабіяграфію, названую U2 by U2 («U2 аб U2»). У працяг тэмы погляду ў мінулае 21 лістапада 2006 года быў выпушчаны альбом U2 18 Singles («18 сінглаў U2»), улучальны ў сябе 16 самых знакамітых песень групы, а таксама бонусам дзве новыя: The Saints Are Coming («Святыя ідуць»), выкананы разам з групай Green Day, і Window in the Skies («Акно на нябёсах»). Ёсць адна- і двухдыскавае выданні, а таксама, абмежаваны выпуск DVD, на якім знаходзіцца відэа з канцэрту Vertigo Tour у Мілане.

У кастрычніку 2006 года U2, пасля шматгадовага супрацоўніцтва з Island Records, падпісалі кантракт з Mercury Records, якая, як і IR з'яўляецца даччынай кампаніяй Universal Music Group.

23 студзеня 2008 года групай быў выпушчаны ў свет 3D-фільм «U2 3D» з запісам канцэртаў тура 2006 гады Vertigo tour.